Le lac Mývatn repose sur l'une des zones les plus volatiles de la dorsale médio-atlantique, où les plaques tectoniques eurasienne et nord-américaine s'écartent de deux centimètres par an.
Le bassin peu profond s'est formé il y a 2 300 ans lorsqu'une coulée de lave basaltique a barré la rivière Laxá, créant un lac de 37 kilomètres carrés entouré de pseudocratères, de cônes sans racine et de vastes champs de lave. Le nom se traduit par Lac des moucherons, une référence aux denses essaims estivaux de moucherons Chironomidae qui soutiennent l'extraordinaire avifaune de la région. Plus de 115 espèces d'oiseaux ont été recensées ici, notamment des populations nicheuses de garrots d'Islande, de canards arlequins et de phalaropes à bec étroit.
Pour les passagers de croisière arrivant à Akureyri — capitale du nord de l'Islande, à 90 minutes à l'ouest par la route — une excursion au lac Mývatn depuis le port d'Akureyri offre l'introduction la plus concentrée à l'architecture volcanique du nord de l'Islande. L'itinéraire vers l'est traverse la vallée glaciaire de Fnjóskadalur avant de descendre vers Goðafoss, la cascade en fer à cheval de 12 mètres de haut où, selon la saga, le législateur Þorgeir Ljósvetningagoði a jeté ses idoles païennes l'an 1000 pour signaler l'adoption du christianisme par l'Islande. Au-delà de Goðafoss, le paysage passe des terres agricoles à la géologie brute. L'amas de faux cratères de Skútustaðagígar, formé lorsque la lave a coulé sur des zones humides et que l'eau souterraine surchauffée a explosé à travers la croûte en refroidissement, s'élève en dômes couverts de mousse le long de la rive sud. Dimmuborgir — les Châteaux Sombres — présente un labyrinthe de lave vieux de 2 000 ans composé d'arches, de grottes et de chambres magmatiques effondrées, vestiges d'un lac de lave qui s'est vidé alors que sa surface restait partiellement solide.
Le bassin de Mývatn reste volcaniquement actif. Hverir, un champ de solfatare sur les flancs de la crête de Námafjall, exhale de la vapeur sulfureuse par des fumerolles et fait bouillir de la boue grise dans des chaudrons peu profonds, la température de surface atteignant 100°C. Le système volcanique de Krafla, responsable des éruptions des Feux de Mývatn de 1724–1729 et des plus récents Feux de Krafla de 1975–1984, se trouve à cinq kilomètres au nord-est. Víti, un cratère d'explosion bleu-vert au sein de la caldeira de Krafla, s'est rempli d'eau réchauffée géothermiquement après l'éruption de 1724. Les bains naturels de Mývatn, ouverts en 2004, tirent de l'eau minéralisée du même réservoir géothermique qui alimente la centrale de Krafla, offrant une alternative moins fréquentée au Blue Lagoon pour les croisiéristes ayant du temps avant leur départ du port. Chaque élément de la région de Mývatn — lac, cratère, champ de lave et source chaude — documente l'histoire géologique inachevée de l'Islande, écrite en basalte et en vapeur plutôt qu'en glace.
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