El lago Mývatn se asienta sobre uno de los tramos más inestables de la dorsal mesoatlántica, donde las placas tectónicas euroasiática y norteamericana se separan a un ritmo de dos centímetros por año. La cuenca poco profunda se formó hace 2.
300 años cuando una colada de lava basáltica represó el río Laxá, creando un lago de 37 kilómetros cuadrados rodeado de pseudocráteres, conos volcánicos y extensos campos de lava. Su nombre se traduce como "Lago de los Mosquitos", una referencia a los densos enjambres de mosquitos Chironomidae que abundan en verano y que sustentan la extraordinaria avifauna de la región. Se han registrado más de 115 especies de aves aquí, incluyendo poblaciones nidificantes de porrón islándico, pato arlequín y falaropo picofino.
Para los pasajeros de cruceros que llegan a Akureyri, la capital del norte de Islandia, situada a 90 minutos por carretera hacia el oeste, una excursión al lago Mývatn desde el puerto de Akureyri ofrece la introducción más concentrada a la arquitectura volcánica del norte de Islandia. La ruta hacia el este atraviesa el valle glacial de Fnjóskadalur antes de descender a Goðafoss, la cascada en forma de herradura de 12 metros de altura donde, según la saga, el legislador Þorgeir Ljósvetningagoði arrojó sus ídolos paganos en el año 1000 para señalar la adopción del cristianismo en Islandia. Más allá de Goðafoss, el paisaje cambia de tierras de cultivo a geología pura. El grupo de falsos cráteres de Skútustaðagígar, formados cuando la lava fluyó sobre humedales y el agua subterránea sobrecalentada explotó a través de la corteza en enfriamiento, se eleva en domos cubiertos de musgo a lo largo de la orilla sur. Dimmuborgir, los "Castillos Oscuros", presenta un laberinto de lava de 2.000 años de antigüedad formado por arcos, cuevas y cámaras de magma colapsadas, restos de un lago de lava que se drenó mientras su superficie permanecía parcialmente sólida.
La cuenca de Mývatn sigue siendo volcánicamente activa. Hverir, un campo de solfataras en los flancos de la cresta de Námafjall, exhala vapor sulfuroso a través de fumarolas y hierve lodo gris en calderas poco profundas, con temperaturas superficiales que alcanzan los 100°C. El sistema volcánico de Krafla, responsable de las erupciones de los Fuegos de Mývatn de 1724–1729 y de los más recientes Fuegos de Krafla de 1975–1984, se encuentra a cinco kilómetros al noreste. Víti, un cráter de explosión de color azul verdoso dentro de la caldera de Krafla, se llenó de agua calentada geotérmicamente tras la erupción de 1724. Los Baños Naturales de Mývatn, inaugurados en 2004, extraen agua mineralizada del mismo depósito geotérmico que alimenta la central eléctrica de Krafla, ofreciendo una alternativa menos concurrida a la Laguna Azul para los pasajeros de cruceros que disponen de tiempo antes de su partida del puerto. Cada elemento de la región de Mývatn (lago, cráter, campo de lava y aguas termales) documenta la historia geológica inacabada de Islandia, escrita en basalto y vapor en lugar de hielo.
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